BWA

开源短序列比对工具,适合高通量测序 reads 与参考基因组比对。

详细介绍

BWA 是常用开源短序列比对工具,用于将测序 reads 比对到参考基因组。它常用于基因组重测序、变异检测、群体遗传和测序数据预处理流程。

适用场景:测序比对、参考基因组、变异检测、NGS 数据、生物信息

注意:通常与 SAMtools、BCFtools、FastQC 和 MultiQC 等工具组合使用。