ParaAT

ParaAT 是一个面向蛋白编码 DNA 序列的并行比对工具，可根据蛋白比对结果生成对应的密码子比对结果，常用于分子进化和选择压力分析前处理。

适用场景：分子进化、序列分析、密码子比对、并行分析、Ka/Ks 分析前处理

注意：该工具更适合有生物信息和命令行基础的用户；MEGA 更常作为免费图形界面软件使用，但不建议简单标为开源。