SAMtools
开源测序比对文件处理工具,适合 SAM/BAM/CRAM 文件查看、排序和统计。
详细介绍
SAMtools 是开源测序比对文件处理工具,用于查看、转换、排序、索引、统计和过滤 SAM、BAM、CRAM 文件。它是 NGS 数据分析流程中的基础工具之一。
适用场景:BAM 文件处理、测序数据、变异分析、排序索引、生物信息流程
注意:通常与 BWA、Bowtie2、BCFtools、FastQC 和 MultiQC 配合使用。
开源测序比对文件处理工具,适合 SAM/BAM/CRAM 文件查看、排序和统计。
SAMtools 是开源测序比对文件处理工具,用于查看、转换、排序、索引、统计和过滤 SAM、BAM、CRAM 文件。它是 NGS 数据分析流程中的基础工具之一。
适用场景:BAM 文件处理、测序数据、变异分析、排序索引、生物信息流程
注意:通常与 BWA、Bowtie2、BCFtools、FastQC 和 MultiQC 配合使用。